Il y a 2 LED : une verte (led0) et une rouge (led1).
Pour les contrôler, il suffit d'inscrire 0 ou 1 dans /sys/class/leds/$LED/brightness.

Voici un petit script dont je me sers un peu partout (fichier lights) :

#!/bin/bash
#
# Turn on/off Raspberry Pi LEDs.
# Created: 2019-01-27
#
# led0: green
# led1: red
#

lights_state() {
    # $1 is either 0 (off) or 1 (on)
    echo $1 >/sys/class/leds/led0/brightness
    echo $1 >/sys/class/leds/led1/brightness
}

lights_on() {
    lights_state 1
}

lights_off() {
    lights_state 0
}

main() {
    case "${1:-default}" in
        "on")  lights_on ;;
        "off") lights_off ;;
        *)
            echo "Turn on/off Raspberry Pi LEDs."
            echo "Usage: $0 on|off"
    esac
}

main $@

À utiliser tel que :

# Désactiver les LED :
sudo ./lights off

# Ré'activer les LED :
sudo ./lights on